Chrome OS ei tue ns. perinteisiä ohjelmia, jotka tarvitsevat X:n ja sen päälle tavallisen ikkunamanagerin (X löytyy, mutta Aura, käytetty ikkunamanageri, ei ole tavallinen). Sitä ei myöskään ole ajateltu sellaiseksi perinteiseksi PC:ksi, joten näitä ei aiota tukea ja tarkoitus on että käyttäjä ajaa juurikin noita kaupan ohjelmia ja muita selainohjelmia (tai mitä lienevät).
Koneesta riippuen niissä saattaa saada esimerkiksi Ubuntun toimimaan vaihtelevin tuloksin. Grubia ei ole ja BIOSin virkaa hoitaa Coreboot - ainakin x86-vehkeissä, Samsungin uudesta ARM-pohjaisesta en tiedä.