Noniin ongelma ratkaistu...
Eli jostakin syystä synaptic:kin näytti että on asennettuna seka linux-generic että 386 moduuleita... No, poistinsitten 386 kokonaan ja samassa meni nvidia-glx, ja laitoin generic:iin uudelleenasennuksen. Ja bootin jälkeen taas kerrantuo aptitude hässäkkä ja näin taas toimi nvidia. Tällä kertaa molemmat ytimet on, sekä uname -r näyttää "2.6.17-10-generic".
Minä uskon että se oli se kernelpäivityshässäkkä mikä sen alunperin kusi, tai ainakin iso osasyyllinen, koska kaverilla kävi ihan samalla tavalla.
Kiitokset jokatapauksessa avusta kaikille.