Kyllä ne kriittisiä on nimenomaan Windowsin toiminnalle, eli ei kannata koskea niihin Linuxin puolelta. Tiedosto-oikeudet voi saada sekaisin tms. jos tiedostoja siirtelee väärin tms.
Jos tiedät, että Windowsin puolella on oikeasti ihan fyysisesti tilaa vieviä tiedostoja ja kansioita, mutta ne on näkymättömissä Linuxin puolella, niin veikkaisin paria vaihtoehtoa. Ensimmäisenä että tiedostot on kryptatussa Windowsin kansiossa, mutta sitä ei saa kyllä helpolla edes luotua ns. vahingossa. Toinen ja todennäköisin omasta mielestäni on, että olet väärässä kansiossa. Eli nuo linkit voi hyvin myös viitata omalle kiintolevylle. Helpoin on painaa Windowsin puolella oikealla napilla OneDrive ominaisuudet esiin ja katsoa sieltä kansion asetettu sijainti. En ole hetkeen sorkkinut OneDrive juttuja, mutta oletus kansio taitaapi olla suunnilleen seuraava.
C:\users\käyttäjänimi\OneDrive
*lisäys*
Jos haluat pilvestä tiedostot koneelle "väkisin", niin mene Windowsissa OneDrive kansioon ja valitse sopivat sisällöt ja paina oikealla ja valitse "Pidä sisältö laitteessa/Always keep on this device". Muuten esim. puhelimen kuvat synkataan kokonaisuudessaan vain avatessa tiedostoja.