Parasta olisi että home ja käyttis+boot olisivat eri osioilla.
Ei välttämätöntä, jos /home tai /home/käyttäjä on asianmukaisesti varmuuskopioitu, ja palautettavissa, jos tarvis.
Jakelupäivitys on kuitenkin nimenomaan aika suuri muutos järjestelmään. Mielestäni vaihtoehtoina on joko uudelleenasennus - ja järjestelmän konffaaminen tarvittavilta osin, tai päivittäminen ymmärtäen, että jotkin (erityisesti ulkoisista lähteistä asennetut) ohjelmistot voivat vaatia pientä viilausta.
Itse pitäydyn päivityksissä. Jos tuo menee ihan harakoille, ei uudelleenasennus ole suuri ongelma varmuuskopioiden ollessa tallella.
Tai parasta olisi että home/whatever olisi verkossa tai home:netissä.
Tuo toki on nimenomaan varmuuskopio, sijaitsi se sitten missä hyvänsä. Yleensä vain huolehdin siitä, että varmuuskopio on omilla massamuistilaitteillani eikä pitkin internettiä.