Huh! Onpa siitä aikaa, kun tämän aiheen aloitin.
Sen jälkeen on tullut päivitettyä 12.04 versioon ja tänään päivitin Rkhunterin versioon 1.4.0.
Samalla kertaa löysin vastauksen ketjun alussa esittämääni kysymykseen:
Varoitus poistuu kun /etc/rkhunter.conf-tiedostoon lisää
ALLOWHIDDENFILE=/dev/.initramfs'.
Ajaaskel tuota jo lokakuussa ehdotti, mutta versiossa 1.3.8 se ei jostain syystä toiminut.
Joskus kestää aikansa ...