Jos tiedät mitä komentoja voit Linuxissa käyttää ja ne pitäisi saada käynnistyksessä ajettaviksi niin on pari sopivaa paikkaa.
Jos ne pitää ajaa rootina (pääkäyttäjä), lisää ne tiedostoon /etc/rc.local ennen riviä exit0 eli lisää sitä ennen omat rivisi. Älä käytä sudoa, rootin oikeudet tulevat automaattisesti. Muokkaamaan pääset komennolla:
gksudo gedit /etc/rc.local
Jos ne pitää ajaa kirjautuessa, Gnomea käytettäessä voit tehdä niistä tiedoston, jolle annat ajo-oikeuden ja lisäät sen Käynnistyviin ohjelmiin. Tällä tavalla ei kannata ajaa sudon vaativia komentoja.