Kyllä pitäisi pysyä, ja saahan tiedostokytkökset aina muutettua tarvittaessa.
Itse olen yleensä asentanut koneen Ubuntun (siis Gnome-version) rompulta, sitten KDE:n siihen päälle, ja kaikki on pelannut kummassakin hyvin. Lähinnä olen kokenut ongelmaksi sen, että Gnome ja KDE tunkevat tavaraansa vähän eri logiikan mukaan valikoihin (esim. Konsole tulee järjestelmävalikkoon mutta Pääte Apuohjelmiin).