Omassa kannettavassani on joku onneton sis-näytönohjain, mutta siinä on myös ulkoiselle monitorille liitäntä, joten olihan tätä pakko kokeilla.
Alkuperäisillä asetuksilla sama kuva näkyi sekä kannettavan näytössä että ulkoisessa monitorissa, mutta 
tämän ohjeen mukaan sain sorvattua xorg.confin siten että nyt molemmissa näytöissä on eri resoluutio ja virkistystaajuus ja ne toimivat erillisinä näyttöinä.
Ongelmani on vielä siinä, että jos käynnistän esimerkiksi Gimpin, niin en saa työkaluja toiselle ruudulle ja kuvaa toiselle, vaan molemmat ovat aina siinä monitorissa missä sovelluksen käynnistää. Saako näitä jotenkin siirrettyä eri ruudulle?
Tässä oma xorg.confini noilta tärkeimmiltä osilta (syöttölaite- ja fonttirivit ovat ihan vakiot):
...
Section "Module"
        Load    "bitmap"
        Load    "dbe"
        Load    "ddc"
        Load    "dri"
        Load    "extmod"
        Load    "freetype"
        Load    "glx"
        Load    "int10"
        Load    "type1"
        Load    "v4l"
        Load    "vbe"
EndSection
...
Section "Device"
        Identifier      "sis0"
        Driver          "sis"
        BusID           "PCI:1:0:0"
        Option          "UseFBDev"              "true"
        Screen          0
EndSection
Section "Device"
        Identifier      "sis1"
        Driver          "sis"
        BusID           "PCI:1:0:0"
        Option          "UseFBDev"              "true"
        Screen          1
EndSection
Section "Monitor"
        Identifier      "tft"
        Option          "DPMS"
        HorizSync       30-67
        VertRefresh     30-60
EndSection
Section "Monitor"
        Identifier      "Samsung"
        Option          "DPMS"
        HorizSync       30-96
        VertRefresh     50-160
EndSection
Section "Screen"
        Identifier      "Internal"
        Device          "sis0"
        Monitor         "tft"
        DefaultDepth    24
        SubSection "Display"
                Depth           24
                Modes           "1280x800" "1024x768"
        EndSubSection
EndSection
Section "Screen"
        Identifier      "External"
        Device          "sis1"
        Monitor         "Samsung"
        DefaultDepth    24
        SubSection "Display"
                Depth           24
                Modes           "1280x1024" "1024x768"
        EndSubSection
EndSection
Section "ServerLayout"
        Identifier      "DualHead"
        Screen          0       "Internal" 0 0
        Screen          1       "External" LeftOf "Internal"
        InputDevice     "Generic Keyboard"
        InputDevice     "Configured Mouse"
        InputDevice     "stylus" "SendCoreEvents"
        InputDevice     "cursor" "SendCoreEvents"
        InputDevice     "eraser" "SendCoreEvents"
        InputDevice     "Synaptics Touchpad"
EndSection
Section "DRI"
        Mode    0666
EndSection
Mikko
Edit: B-ZaR näköjään jo vastasikin kysymykseeni
Eri resoluutiot kyllä onnistuvat X:n Xinerama-ominaisuudella, kunhan värisyvyys on sama. Ikkunoita ei voi kylläkään siirtää näytöltä toiselle, koska kyseessä on kaksi X-serveriä. Aseta vain X:n konffaustiedostosta screenien suhteet merkitsemällä esim "screen naytto1 RightOf naytto2".