Itselläni ainakin onnistui siirto edellä mainitulla tavalla.
Windowssin puolella mailit thunderbirdiin ja sieltä sitten kopioin thunderbirdin profiilin linuxin puolelle. Muistaakseni ääkkösillä nimetyt kansiot meni hieman omituisiksi mutta muutin ne vään käsin tyyliin "Lähetety" yms...