Eli gksudoa voi käyttää esimerkiksi pikakuvakkeessa, joka käynnistää jonkin ohjelman root -oikeuksilla. Tavallista sudoa käyttäessä ei olisi tarjolla mitään terminaali-ikkunaa, jonne sen salasanan voisi kirjoittaa.
gksudoa kannatta käyttää myös komentoriviltä, jos käynnistät graafisen ohjelman. Ainakin näin olen käsittänyt, että se estäisi tiettyjen konffitiedostojen oikeuksien muuttumisen, jonka suoraan sudolla käynnistäminen saattaa aiheuttaa.