Sulla on läppärin oma näyttö ja HDMI:llä joku näyttö? Eli millaista settiä haluat? Kumpi näytöistä pitää olla 1600x900 vaiko molemmat? Jos ei molemmissa, niin mikä resoluutio pitää toisessa olla? Luultavasti HDMI:n kautta ei tosin 1600x900 toimi eli ilmeisesti haluat sinne jotain muuta? 
Eli toimisko aika minimalistinen /etc/X11/xorg.conf -tiedosto? Tässä oletetaan että haluat HDMI:lle 1360x768 ja läppärin omalle 1600x900. Eli sisältö voisi olla jotain tälläista (ei testattu, vaan tehty aika pitkälti manuaaleja lukemalla):
Section "Monitor"
    Identifier     "Monitor0"
    PreferredMode  "1360x768"
EndSection
Section "Monitor"
    Identifier     "Monitor1"
    PreferredMode  "1600x900"
    Option         "Position" "1360 0"
    Option         "RightOf"  "Monitor0"
EndSection
Section "Device"
    Identifier     "Device0"
    Driver         "intel"
    Option         "monitor-HDMI-1" "Monitor0"
    Option         "monitor-LVDS" "Monitor1"
EndSection
Section "Screen"
    Identifier     "Screen0"
    Device         "Device0"
    Monitor        "Monitor1"
    DefaultDepth   24
    SubSection     "Display"
        Depth      24
        Virtual    3000 1000
        Modes      "1600x900" "1360x768" "1024x768" "800x600"
    EndSubSection
EndSection
Ton jälkeen X:n uudelleenkäynnisty tai vaihtoehtoisesti reboot. Jos ei X starttaa ollenkaan, niin tuhoa vaikka Recovery moodissa toi tiedosto. 
Edit: Tai sitten teet vaihtoehtoisesti skriptin, joka ajetaan esimerkiksi kirjautuessa ja jossa xrandr:ia hyväksikäyttäen asetellaan oikeat resoluutiot.