Sain tällä onnistumaan, mutta ääni on aika huonoa, mutta ennen ei kännykkä pihahtanutkaan, eli voisin sanoa että ratkaistu.
ffmpeg -i InputVid.flv -s qcif -vcodec h263 -r 10 -b 180 -sameq -ab 64 -acodec aac -ac 1 -ar 22050 OutputVid.3gp
InputVidin tilalle tiedoston nimi, ja OutputVidin tilalle voi laittaa saman, ellei sitten halua vaihtaa tiedoston nimeä.
Komento pitää siis ajaa päätteellä kansiossa jossa tiedosto on.
edit: nimi pitää ehkä pistää lainausmerkkeihin, jos siinä on välilyöntejä