NTFS -levyn kanssa voi tulla pieniä ongelmia asennuksen kanssa, ainakin 6.06:sen kanssa. Kun asensin Dapperin NTFS-levylle, jouduin asentamaan sen 4-5 kertaa uudelleen, koska edelliset asennukset eivät onnistuneet. Kannattaa myös olla varovainen partitioiden kanssa, koska pahimmassa tapauksessa joudut tyhjentämään koko levyn, jos asennus epäonnistuu.